汽车发生自燃，投了自燃险的话，保险公司会进行理赔的：

1、保险条款中有规定，车主只能在购买车损险的基础上，可以附加自燃险的，以保护汽车发生自燃造成的损失；

2、自燃保险由车辆在行驶、停车过程中，因电气线路、供油系统故障或其自身原因引起的火灾中所包含的物品提供保障；

3、车损险有规定的赔偿范围，如果您的险是自燃损失，但您没有上自燃险，保险公司肯定不会根据自燃险理赔给您的。